D'après le dossier de dommages de guerre, l´ancienne église du 13e siècle, dédiée à la Vierge, était bâtie sur un petit tertre à l´extrémité est du village. Entourée d´un mur de clôture, elle comprenait une nef centrale avec collatéraux, deux bras de transept, une abside et une sacristie. Les murs étaient composés de deux parements en pierre de taille dont le remplissage était en moellons, construits sur des fondations en moellons et chaux, épaulés par des contreforts en pierre. Les piliers de la nef centrale ainsi que les pilastres adossés des collatéraux étaient pourvus de chapiteaux sculptés sur socles moulurés. Les voûtes d´arêtes en pierre et nervures moulurées couvraient le choeur ainsi que le transept. La nef et le bas-côté nord furent plafonnés en 1872. Le collatéral fut restauré peu avant. Les murs du cimetière furent réparés vers 1884. Des travaux d´urgence furent entrepris en 1892 en raison de la forte dégradation de l´édifice. Les voûtes et la toiture subirent une restauration vers 1895. Lors de la Première Guerre mondiale, l´église fut totalement détruite ; seuls quelques pans de murs subsistèrent au niveau du choeur, mais ne purent être conservés. Les fondations restèrent intactes. Le dossier de dommages de guerre fut rédigé par Armand Guérard, architecte expert à Soissons. M. Larminat, architecte de la coopérative de reconstruction de Filain, établit le plan de l'église. Charles Abella, également architecte, en dirigea le chantier dont l'entrepreneur était M. Marchand. Les travaux, achevés le 27 juin 1926, furent complétés en août 1928. Durant toute la durée de la construction, Filain bénéficia de la présence d´une baraque-chapelle en bois. Le clocher fut agrandi postérieurement afin de pouvoir recevoir trois cloches au lieu des deux initialement prévues. L´édifice fut une fois de plus légèrement touché pendant la Seconde Guerre mondiale, lors des bombardements d´artillerie et d´aviation qui eurent lieu en juin 1940 : seule la sacristie eut à subir quelques dégâts. L´église fut réparée dès 1948 par la société coopérative de reconstruction des églises et édifices religieux sinistrés de l´Aisne. Les travaux semblent avoir duré environ une décennie puisqu'ils se sont achevés en 1959.