L'évolution de l'ameublement et du décor de l'église de Bazoches sont mal connues, et ne sont documentées que par quelques éléments conservés ou des mentions dans les textes. La cuve baptismale du 12e siècle est le seul élément subsistant contemporain de la construction de l'église, qui a été réaménagée durant le premier quart du 17e siècle (retable architecturé du maître-autel), puis probablement au 18e siècle (autels secondaires et retables de la Vierge et de saint Rufin et saint Valère). La confrérie consacrée à ces deux derniers saints et martyrs locaux est fondée en 1716 par le curé de la paroisse, Complain, et renaît au 19e siècle. Les statues en bois des deux saints, préservées durant la Révolution, auraient par la suite été placées sur le clocher où elles ont disparu. Lors de la restauration de l'église après la Première Guerre mondiale, un nouveau mobilier est venu remplacer les éléments détruits ou endommagés (maître-autel et partie centrale de son retable, autels de la Vierge et de saint Pierre, clôture de chœur, confessionnal, chaire à prêcher, chemin de croix). La commande de verrières au peintre-verrier Raphaël Lardeur, en 1930-1931, n'a pas abouti. Un autel conforme à la nouvelle liturgie a été placé dans la croisée du transept après le concile de Vatican II.